####################为检测漳平市水松群体遗传多样性,揭示群体遗传结构及探讨水松濒危机制, ### 简化基因组测序,经研究决定, ### 。 ### 如下:
一、项目名称:漳平市水松简化基因组测序服务项目
二、项目控制价:#万元
三、服务期限:自签订合同之日起一年
四、项目委托内容及要求:
(一) ### 提供的###个水松DNA样品检测指标如下:浓度:≥## ng/μL,单样本总量≥# μg;完整性:通过琼脂糖凝胶电泳检测,主带清晰,无明显降解。检测报告:需提供每个样品的浓度及完整性检测数据和胶图。
(二) ### 建库建库技术:需采用简化基因组测序技术(ddRAD-seq),可根据水松基因组特性选择合适的酶切方案,多种酶切组合可选择,具体如下:EcoRI + MseI、PstI + MseI、SbfI + MseI、SacI + MseI。文库类型:需为双端测序(PE),插入片段长度控制在###-###bp,合格的DNA样本保证建库成功。建库报告:中标方需提供文库质检报告,包括片段大小分布、浓度、Q-Sep###检测图。
(三)进行高通量测序测序平台:使用 Illumina NovaSeq 测序平台,测序策略PE###。测序量:##G raw data/样,总测序量为#### Gb;测序数据过滤后 Q## ≥ ##%,若单样本 Q####%中标方需免费重新测序;中标方需承诺提供测序数据的完整性以及真实性,确保数据合同期限内无丢失、无篡改。
(四)完成###个水松样品的生物信息学分析完成基础数据质控分析和标准分析。完成数据高级分析包括群体遗传多样性分析、PCA分析、群体遗传结构分析、系统发育树构建、组建SNP差异分析、 ### 络、连锁不平衡分析、遗传图谱构建、QTL定位等。
五、付款方式:
完成###个水松样品的测序分析工作后, ### ### 数据和分析报告, ### 费用。比选文件发布时间、方式或事项, ### 一并发布, ### ### 下载比选文件。
下载比选文件开始时间:####年#月#日。
六、比选须知
(一)参选方需提供合格有效的营业执照。
(二)参加比选的单位应于####年#月##日上午##:##前将比选文件,包含附件中的比选投标报价单(项目总报价,加盖公章)、授权委托书、委托代理人身份证复印件、法人营业执照(复印件需加盖公章)、公司资质证明文件等(复印件需加盖公章), ### 办公楼###室,收件人:吴先生,联系电话:####-########,逾期将不予接受。
(三)中选方的确定:最低价中标。
(四)开选时间和地点:
开选时间:####年#月##日上午##:##。
开选地点: ### 办公楼四楼会议室。
(五)中选结果公示:开选结束, ### ### 公布,公示期#个工作日。
(六)项目招选方: ### ,联系地址: ### 上赤桥##号。
联系人:吴先生联系电话:####- ### 址: ###
### ####年#月#日
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